Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pms2P54279 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pms2P54279 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pms2P54279 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pms2P54279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pms2P54279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pms2P54279 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pms2P54279 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pms2P54279 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pms2P54279 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pms2P54279 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pms2P54279 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pms2P54279 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pms2P54279 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pms2P54279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms