Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PctpP53808 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PctpP53808 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PctpP53808 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PctpP53808 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PctpP53808 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PctpP53808 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PctpP53808 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PctpP53808 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PctpP53808 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PctpP53808 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PctpP53808 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PctpP53808 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PctpP53808 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PctpP53808 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PctpP53808 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PctpP53808 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PctpP53808 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PctpP53808 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PctpP53808 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PctpP53808 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PctpP53808 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PctpP53808 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PctpP53808 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PctpP53808 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PctpP53808 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PctpP53808 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PctpP53808 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PctpP53808 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PctpP53808 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PctpP53808 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PctpP53808 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PctpP53808 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PctpP53808 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PctpP53808 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PctpP53808 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PctpP53808 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PctpP53808 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PctpP53808 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PctpP53808 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PctpP53808 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PctpP53808 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PctpP53808 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PctpP53808 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PctpP53808 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PctpP53808 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PctpP53808 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PctpP53808 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PctpP53808 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PctpP53808 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PctpP53808 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PctpP53808 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PctpP53808 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PctpP53808 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PctpP53808 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PctpP53808 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PctpP53808 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PctpP53808 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms