Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Cux1P53564 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Cux1P53564 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Cux1P53564 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cux1P53564 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,18
Cux1P53564 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cux1P53564 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cux1P53564 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cux1P53564 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cux1P53564 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cux1P53564 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,8 ms