Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClgnP52194 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClgnP52194 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClgnP52194 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ClgnP52194 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClgnP52194 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms