Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1swP51491 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1swP51491 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms