Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CastP51125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CastP51125 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CastP51125 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CastP51125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CastP51125 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CastP51125 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CastP51125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CastP51125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CastP51125 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CastP51125 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CastP51125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CastP51125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CastP51125 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CastP51125 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CastP51125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CastP51125 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CastP51125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CastP51125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CastP51125 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CastP51125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CastP51125 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CastP51125 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CastP51125 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CastP51125 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CastP51125 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CastP51125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CastP51125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CastP51125 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CastP51125 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CastP51125 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CastP51125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CastP51125 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CastP51125 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CastP51125 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CastP51125 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CastP51125 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CastP51125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CastP51125 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CastP51125 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CastP51125 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CastP51125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CastP51125 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CastP51125 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CastP51125 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CastP51125 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CastP51125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CastP51125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CastP51125 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CastP51125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CastP51125 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CastP51125 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CastP51125 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CastP51125 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CastP51125 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CastP51125 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CastP51125 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CastP51125 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CastP51125 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CastP51125 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CastP51125 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CastP51125 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CastP51125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CastP51125 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CastP51125 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CastP51125 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CastP51125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms