Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa8P50706 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa8P50706 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa8P50706 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa8P50706 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Defa8P50706 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Defa8P50706 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa8P50706 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms