Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpdP50404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpdP50404 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpdP50404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpdP50404 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpdP50404 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpdP50404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpdP50404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SftpdP50404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms