Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VegfbP49766 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VegfbP49766 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VegfbP49766 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VegfbP49766 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VegfbP49766 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VegfbP49766 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VegfbP49766 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VegfbP49766 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VegfbP49766 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VegfbP49766 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VegfbP49766 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms