Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpdP49429 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpdP49429 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpdP49429 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpdP49429 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpdP49429 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpdP49429 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpdP49429 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpdP49429 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpdP49429 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpdP49429 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpdP49429 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpdP49429 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpdP49429 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpdP49429 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpdP49429 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpdP49429 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpdP49429 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpdP49429 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpdP49429 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpdP49429 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpdP49429 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpdP49429 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpdP49429 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpdP49429 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpdP49429 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpdP49429 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpdP49429 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpdP49429 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpdP49429 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HpdP49429 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpdP49429 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpdP49429 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpdP49429 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpdP49429 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpdP49429 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpdP49429 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpdP49429 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpdP49429 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpdP49429 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpdP49429 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HpdP49429 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HpdP49429 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HpdP49429 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HpdP49429 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpdP49429 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpdP49429 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpdP49429 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpdP49429 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpdP49429 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpdP49429 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpdP49429 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpdP49429 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpdP49429 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HpdP49429 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpdP49429 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpdP49429 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms