Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbp3P49194 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbp3P49194 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbp3P49194 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms