Protein–RNA interactions for Protein: P49003

Bmp5, Bone morphogenetic protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp5P49003 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp5P49003 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bmp5P49003 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bmp5P49003 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms