Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbx2P48031 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbx2P48031 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms