Protein–RNA interactions for Protein: P47941

Crkl, Crk-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrklP47941 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrklP47941 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrklP47941 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrklP47941 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrklP47941 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrklP47941 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CrklP47941 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrklP47941 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrklP47941 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrklP47941 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrklP47941 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrklP47941 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrklP47941 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrklP47941 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrklP47941 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrklP47941 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrklP47941 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrklP47941 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrklP47941 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrklP47941 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrklP47941 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrklP47941 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrklP47941 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrklP47941 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrklP47941 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrklP47941 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrklP47941 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrklP47941 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrklP47941 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrklP47941 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CrklP47941 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrklP47941 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrklP47941 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrklP47941 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CrklP47941 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CrklP47941 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CrklP47941 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrklP47941 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CrklP47941 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrklP47941 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrklP47941 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrklP47941 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrklP47941 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrklP47941 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrklP47941 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrklP47941 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrklP47941 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CrklP47941 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrklP47941 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrklP47941 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CrklP47941 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CrklP47941 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CrklP47941 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CrklP47941 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CrklP47941 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrklP47941 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrklP47941 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CrklP47941 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CrklP47941 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CrklP47941 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CrklP47941 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CrklP47941 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CrklP47941 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CrklP47941 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CrklP47941 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CrklP47941 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CrklP47941 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CrklP47941 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CrklP47941 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms