Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Resp18P47939 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Resp18P47939 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Resp18P47939 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Resp18P47939 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms