Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc2P46471 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc2P46471 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc2P46471 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms