Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf6P43028 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gdf6P43028 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf6P43028 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf6P43028 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms