Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx1-2P42580 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Nkx1-2P42580 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-2P42580 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-2P42580 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms