Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ighmbp2P40694 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighmbp2P40694 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms