Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd9P40240 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd9P40240 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd9P40240 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd9P40240 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd9P40240 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd9P40240 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd9P40240 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd9P40240 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd9P40240 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd9P40240 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd9P40240 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms