Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf1P39428 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf1P39428 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf1P39428 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf1P39428 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf1P39428 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf1P39428 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf1P39428 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf1P39428 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms