Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TpoP35419 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TpoP35419 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TpoP35419 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TpoP35419 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TpoP35419 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TpoP35419 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TpoP35419 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TpoP35419 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TpoP35419 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TpoP35419 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TpoP35419 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TpoP35419 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TpoP35419 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TpoP35419 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TpoP35419 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TpoP35419 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TpoP35419 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TpoP35419 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TpoP35419 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TpoP35419 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TpoP35419 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TpoP35419 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TpoP35419 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TpoP35419 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TpoP35419 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TpoP35419 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TpoP35419 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TpoP35419 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TpoP35419 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TpoP35419 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TpoP35419 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TpoP35419 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TpoP35419 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TpoP35419 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TpoP35419 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TpoP35419 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TpoP35419 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TpoP35419 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TpoP35419 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TpoP35419 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TpoP35419 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TpoP35419 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TpoP35419 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms