Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpardP35396 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpardP35396 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpardP35396 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PpardP35396 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpardP35396 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpardP35396 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpardP35396 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpardP35396 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpardP35396 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PpardP35396 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpardP35396 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpardP35396 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpardP35396 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PpardP35396 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PpardP35396 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpardP35396 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpardP35396 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpardP35396 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpardP35396 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PpardP35396 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PpardP35396 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PpardP35396 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PpardP35396 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PpardP35396 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PpardP35396 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpardP35396 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PpardP35396 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PpardP35396 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PpardP35396 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpardP35396 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpardP35396 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpardP35396 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpardP35396 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PpardP35396 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpardP35396 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpardP35396 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpardP35396 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpardP35396 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpardP35396 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpardP35396 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpardP35396 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PpardP35396 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms