Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms