Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk4P30285 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk4P30285 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk4P30285 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms