Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NapbP28663 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NapbP28663 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NapbP28663 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NapbP28663 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NapbP28663 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NapbP28663 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NapbP28663 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NapbP28663 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NapbP28663 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NapbP28663 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NapbP28663 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NapbP28663 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NapbP28663 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NapbP28663 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NapbP28663 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NapbP28663 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NapbP28663 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NapbP28663 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NapbP28663 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NapbP28663 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NapbP28663 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NapbP28663 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NapbP28663 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NapbP28663 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NapbP28663 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NapbP28663 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NapbP28663 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NapbP28663 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NapbP28663 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NapbP28663 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NapbP28663 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NapbP28663 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NapbP28663 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NapbP28663 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NapbP28663 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NapbP28663 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NapbP28663 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NapbP28663 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NapbP28663 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NapbP28663 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NapbP28663 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NapbP28663 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NapbP28663 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NapbP28663 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NapbP28663 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NapbP28663 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NapbP28663 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NapbP28663 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NapbP28663 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapbP28663 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapbP28663 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapbP28663 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapbP28663 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NapbP28663 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NapbP28663 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NapbP28663 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapbP28663 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms