Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa5P28312 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa5P28312 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms