Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja4P28235 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja4P28235 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja4P28235 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja4P28235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja4P28235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja4P28235 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja4P28235 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja4P28235 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms