Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjc1P28229 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjc1P28229 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjc1P28229 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms