Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfraP26618 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfraP26618 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms