Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd19P25918 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd19P25918 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd19P25918 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd19P25918 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd19P25918 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd19P25918 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd19P25918 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms