Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZfaP23607 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfaP23607 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZfaP23607 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms