Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms