Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RarbP22605 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RarbP22605 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RarbP22605 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RarbP22605 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RarbP22605 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RarbP22605 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RarbP22605 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RarbP22605 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RarbP22605 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RarbP22605 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RarbP22605 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RarbP22605 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RarbP22605 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RarbP22605 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RarbP22605 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RarbP22605 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RarbP22605 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RarbP22605 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RarbP22605 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RarbP22605 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RarbP22605 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RarbP22605 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RarbP22605 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RarbP22605 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RarbP22605 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RarbP22605 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RarbP22605 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RarbP22605 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RarbP22605 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RarbP22605 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RarbP22605 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RarbP22605 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RarbP22605 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RarbP22605 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RarbP22605 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RarbP22605 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RarbP22605 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RarbP22605 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RarbP22605 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RarbP22605 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RarbP22605 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RarbP22605 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RarbP22605 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RarbP22605 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RarbP22605 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RarbP22605 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RarbP22605 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RarbP22605 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms