Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clk1P22518 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clk1P22518 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Clk1P22518 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clk1P22518 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms