Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Myo5bP21271 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo5bP21271 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5bP21271 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5bP21271 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myo5bP21271 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5bP21271 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms