Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SagP20443 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SagP20443 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SagP20443 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SagP20443 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SagP20443 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SagP20443 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SagP20443 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SagP20443 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SagP20443 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SagP20443 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SagP20443 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SagP20443 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SagP20443 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SagP20443 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SagP20443 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SagP20443 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SagP20443 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SagP20443 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SagP20443 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SagP20443 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SagP20443 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SagP20443 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SagP20443 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SagP20443 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SagP20443 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SagP20443 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SagP20443 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SagP20443 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SagP20443 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SagP20443 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SagP20443 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SagP20443 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SagP20443 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SagP20443 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SagP20443 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SagP20443 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SagP20443 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SagP20443 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SagP20443 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SagP20443 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SagP20443 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SagP20443 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms