Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnc1P19123 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.2 ms