Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps6ka1P18653 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms