Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PcnaP17918 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PcnaP17918 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnaP17918 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnaP17918 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnaP17918 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PcnaP17918 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnaP17918 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcnaP17918 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PcnaP17918 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms