Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms