Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rag1P15919 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rag1P15919 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rag1P15919 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rag1P15919 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rag1P15919 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rag1P15919 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rag1P15919 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rag1P15919 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms