Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2bP12400 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla2bP12400 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla2bP12400 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms