Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl2P10889 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms