Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnmt3cP0DOY1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms