Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna9P09235 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ifna9P09235 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms