Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl1P05977 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl1P05977 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Myl1P05977 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl1P05977 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myl1P05977 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myl1P05977 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms