Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgamP05555 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgamP05555 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgamP05555 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgamP05555 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgamP05555 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgamP05555 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgamP05555 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgamP05555 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgamP05555 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms