Protein–RNA interactions for Protein: P04345

Cryga, Gamma-crystallin A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygaP04345 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygaP04345 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygaP04345 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrygaP04345 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrygaP04345 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrygaP04345 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrygaP04345 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CrygaP04345 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms