Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb1P04230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb1P04230 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms