Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa7P02830 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa7P02830 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxa7P02830 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms